苹果园以有机肥作为基肥，一般秋季施用较好，利于根的吸收并增加贮藏营养。
具体时间以断根后仍能发出新根、地上部又因气温的下降已不再引起秋梢的生长为宜。对生长过旺的幼树，基肥可移至早春或夏季，能通过施肥时断根而抑制新梢生长，利于幼树早成花。
